仮想敵国に繋がる海峡の近くにある空軍基地、メリダ島。
有事に前進基地として運用されるこの基地に、2機の無人戦闘機が試験飛行を行うために飛来した。
しかし試験飛行当日、島は転移してしまったのだった。

とある世界に国がありました。
その国で建造された小さな軍艦がありました。その船は退役直前に戦争が起こってしまい、輸送船団の護衛をしていましたが、敵潜水艦の雷撃を受け、沈没してしまいました。が、気が付くとその船は平和な異世界の海に浮かんでいました。これは、小さな軍艦と、その魂が人の形になった少女の、第二の人生。