まず、その小説の題材にしたところに問い合わせなどはしましたか？　
許可をもらっているのならあらかた大丈夫ですが、もらっていないのなら今すぐ確認をしたほうがいいです。
著作権に関わりますので、下手したら訴えられることもあります。

そのあたりがいまいちわからない、そこまですることはできない、
というなら今すぐ作品を消したほうがいいです。

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二次創作で1番やってはいけないことは、原作者様に問い合わせることです。これだけは不文律にして大前提です。

二次創作に関する説明はものすごく長い話になるので、当サイト内に関しては利用規約に目を通して頂くのが一番いいと思います。

利用規約
↓
【３】個別規定[小説全般]
↓
二次小説の投稿について

と進んでいけばわかると思います。管理人様がわかりやすく説明してくれています。

タイトルにキャラクターの二つ名を使ってはいけないという指摘に関してですが、これは二つ名が事実上の固有名詞として認識されるからだと思います。

例えば、鬼滅の刃の冨岡義勇の二次創作を書く人が複数存在するとします。その投稿作品の全てで、
「水柱」全3話
「水柱」全11話
「水柱」全6話
みたいになると困りますよね。これはどちらかといえば、検索避けなどのマナー的な話になります。

東方Projectに関しては二次創作のガイドラインがありますので、そちらに関してはご自身で調べて頂ければ幸いです。

訴えられるかも？みたいな話にはさらに慎重な説明が必要なのですが、このサイトの利用規約を守っている限りは、特に心配はないと思います。