ご意見ありがとうございます。

はじめに申し上げておきますが、ライト版は新規受付を停止しており、今後はアーカイブ化していくでしょう。
そのため、ライト版へ新しい機能の追加や、デザインの一新などはないと思ってください。

こちらを前提に、話を進めてまいります。

まず、あなたの希望としては一言でいうと

登録版をライト版のデザインと同じものにして欲しい

ということのようです。

登録版が「使いにくい」とのことですが、それは個人の受け取り方は様々ですので、あなたがそう思われることを否定いたしません。

おそらく、あなたは普段からライト版をお使いで、そちらのデザインに慣れている、ということも大きな原因になっているかと思います。

ただ、次の文章についてはどういったことを希望しているのかがわかりかねますので、もう少し具体的にお伝えいただければと思います。
　

「文字の大きさにすることで」というのはどういう状況でしょうか。
文字の大きさを同じにする、という意味でしょうか？

もしそうだったとしてお話をすると、ライト版は文字の大きさを大、中、小と３つの大きさに切り替えることができます。ですが、登録版にはその機能はありません。そのため、ライト版に移動すると、文字の大きさに違和感を覚えるのでしょう。

もし、あなたの要望が「文字の大きさを同じにする」だったとしたら、ライト版から文字の大きさ切り替え機能を削除するか、登録版にも文字の大きさの切り替え機能をつけるか、のどちらかを検討したいと思います。

　
「色を同じに」という部分ですが、ライト版も登録版も、どちらもバックは白、文字は黒、と統一されております。（ダークモードの場合は白黒逆転。）
色の違いといえば、ページ上部の「ライト版」という文字がある部分や、ナビゲーション部分です。
その部分が「目がチカチカ」する、ということでしょうか？
もう少し具体的にお知らせいただければと思います。