>著作権期間が切れた作品は
二次創作に入りますか？

とのことですが、おそらく

著作権保護期間が切れた作品の二次創作は、『二次創作』に分類するべきかどうか

ということをお聞きしたいのかと思います。

その前提でお話ししますと「二次創作」に分類してください。

著作権が切れた作品は、自由に使ってもいいということになっています。
ですが、著作権が切れたあとも、著作権者の遺族が「これは著作権者の意志を尊重していない」、「イメージに著しく損害を与える」等と訴える権利を所有していますので、何もかもが自由であるとは限りません。

仮に、著作権が切れている、夏目漱石の「坊っちゃん」の二次創作を書いたとします。
その二次創作の内容が、田舎の旧制中学校に赴任した主人公が「山嵐」とタッグを組んで「赤シャツ」を云々………そんな内容だったとして、それを自分が０から書き上げた全くのオリジナルだと主張すれば、あまりに作者の気持ちを蔑ろにしていると思いませんか。それを読んだ読者からも、悪印象を受けるはずです。

無用なトラブルを避けるためにも、著作権が切れた作品であっても、二次創作は「二次創作」に分類してください。